BIBI-DB est un ensemble de bases de données hiérarchisées d'un point de vue taxonomiques orientées vers la phylogénie des Archaea et Bactéria. Il permet grace à une interface web le positionnement phylogénétique des séquences nucléiques (orientant vers l'identification). RiboDB est une base de données de protéines ribosomiques des Archaea et Bacteria librement interrogeable via Internet.
leBIBI est une application web utilisée mondialement pour identifier des bactéries dans les laboratoires hospitaliers, industriels, environnementaux.
Les bases de données de leBIBI et de RiboDB sont utiles pour classer plus rigoureusement les bactéries et mettre en évidence de nouvelles espèces pathogènes ou non. Leur emploi permet d'expliquer l'évolution du monde microbien. RiboDB doit permettre à moyen terme d'améliorer la qualité du diagnostic des infections.
RiboDB team initiator
RiboDB engine algorithms
RiboDB construction engine creator and database set-up
RiboDB
BibiDB construction engine associated API
BibiDB
RiboDB, proteomic side
Automation of phylogenies
leBIBI-PPF
RiboDB and leBibi server set-up and management
RiboDB engine management
δO18 in ancient and recent biology
δO18 in ancient and recent biology
Industrial microbiology
WGS with nanopore ONT
Antibiotics Resistance-linked genes
